על פי החשד, בזמן שהחלה המשטרה בחקירת ארגון הפשיעה בכרי וראש העיר לשעבר סלאם, ניסה בנימין לקבל פרטים על החקירה, תוך שהוא לכאורה משמיט את קשריו האישיים מתקופתו כמפקד תחנת נצרת, כמפקד ימ"ר צפון ובהמשך כראש להב. עוד על פי החשד, בנימין שיתף את סלאם במידע משטרתי רגיש, ולכאורה ניסה גם להניח את ידו על חומרי חקירה שנאספו נגדו.
ניצב בנימין נחקר בחשד להפרת אמונים ושימוש לרעה בכוח המשרה. מח"ש הטילה עליו תנאים מגבילים, ובהם איסור יצירת קשר עם גורמים המעורבים בפרשה. במח"ש מציינים כי החקירה, המתבצעת על ידי צוות חשיפה, נמשכת.
במשטרה מציינים כי ארגון בכרי מזוהה בשנים האחרונות עם פעילות עבריינית ענפה ברחבי הצפון - החל בגביית דמי חסות וסחיטה באיומים, דרך השתלטות על מכרזים, ועד לקשר לכאורה לאירועי רצח חמורים על רקע מאבקי כוחות מול ארגוני פשיעה מתחרים. בהתאם לממצאי החקירה, צפויה ימ"ר צפון לבקש מבית משפט השלום בנוף הגליל-נצרת להאריך את מעצרם של החשודים המרכזיים.
על פי גורמי חקירה, ארגון בכרי "שם את ידו” לכאורה על מנגנון הכספים של העירייה ופעל בו כמעט ללא הגבלה, עד כדי הפיכתו ל"מכבסת כספים" עבור הארגון.
עוד אמר: "הטענה כי קשר מקצועי גלוי וידוע מסוג זה יוצר ניגוד עניינים, מעלה מחשבות נוגות ביחס לחקירה המתנהלת. בניגוד לנטען בדבר הניסיון להעביר את החקירה ליחידה תחתיו, ראש להב הוא שקבע לכתחילה מי ינהל את החקירה, והעברת התיק נעשתה בין שתי יחידות כפופות לו משיקולים מקצועיים. העובדה שמח"ש ממשיכה לטעון לחשדות בנושא, ובמיוחד הקישור הנטען לארגון פשיעה, היא מעשה שלא ייעשה - הפוגע לשווא בניצב בנימין ובאמון הציבור במערכת האכיפה".