בהתייחס לנאמר בדו"ח עצמו מדגישים במשטרה: "חלק ניכר מהממצאים בדו"ח מתייחס לתמונת מצב שנבחנה עד סוף שנת 2024, בעוד שבמהלך 2025 בוצעו במשטרת ישראל מהלכים אירגוניים, מבצעיים ואסטרטגים משמעותיים, אשר כבר הביאו לשינוי ניכר בשטח ולחיזוק המשילות בנגב". בעניין סוגיה זו אומרים במשטרה: "מדובר באתגר לאומי רחב ומורכב המחייב שילוב זרועות של כלל משרדי הממשלה, גופי האכיפה והרשויות הרלוונטיות, ולא של המשטרה בלבד. חרף זאת, משטרת ישראל פועלת בשנה האחרונה ביתר שאת, במעשים ולא בסיסמאות, לחיזוק הביטחון האישי, להגברת ההרתעה, למאבק בפשיעה החמורה ולהחזרת המשילות לכל אזור הדרום".
במשטרה מצביעים על מספר פעולות שנועדו להגביר את יכולת האכיפה: "יובהר כי המשרד לביטחון לאומי פעל בשלוש השנים האחרונות לחיזוק משמעותי של המשילות בנגב. לצד הקמה של תחנת משטרה בשגב שלום בהנחיית השר לביטחון לאומי, הוצף השטח במאות שוטרים בשנים האחרונות, עם גידול של עשרות אחוזים בהיקף המתגייסים למשטרה ומערך הקבע. במחוז הדרום לבדו, נוספו מאות תקנים של שוטרים וכלי רכב, שפועלים בין היתר בפזורה. בנוסף, הוקצו תוספות שכר ייחודיות לשוטרים המשרתים בתחנות במגזר ובפזורה. כמו כן, הוקם המשמר הלאומי והוקצו לו מאת תקנים ועשרות מיליוני שקלים במטרה להיאבק בפשיעה ובנשק בלתי חוקי במגזר ובפזורה".
התגובה סותרת את דברי המבקר, בעניין הבניה הבלתי חוקית. על פי נתוני המשרד לביטחון לאומי, בוצעו יותר הריסות של מבנים בלתי חוקיים מאשר בשנים קודמות: "במסגרת מדיניות השר והמפכ"ל, חל שינוי משמעותי לטובה גם באשר לאכיפה נגד הבניה הבלתי חוקית בנגב, כאשר כוחות המשטרה פועללים לסייע בעניין. היקפי האכיפה כמעט הוכפלו בתוך שלוש שנים בלבד. כך בשנת 2025 בוצעו 5742 הריסות של מבנים בלתי חוקיים. חל זינוק של 168% במימוש פסקי דין שיפוטיים בין 2022 ל 2025 וקפיצה של 177% בפתיחת תיקים שיפוטיים חדשים באותן שנים. החוק נאכף ללא פשרות גם בלב אזורי הבניה הבלתי חוקית". תגובת המשטרה מתייחסת גם לבעיית כוח האדם שהוצגה בדו"ח המבקר.
במשטרה אומרים כי פערי האיוש ב-2025 צומצמו מאד בתחנות שגב שלום, ערוער, עיירות ורהט. עוד נמסר כי הפערים באיוש נובעים בין היתר מעומסים שנוצרו בעקבות מלחמת חרבות ברזל, לאחר שמחוז הדרום ספג אבדות קשות ובהן שוטרים שנפלו ב-7 באוקטובר 2023, דבר שהשפיע על כוח האדם והאיוש. המשטרה דוחה גם את דברי המבקר, לפיהם נפתחו מעט תיקי פוליגימיה. על פי התגובה, הוקם ב-2024 מחלק יעודי ביחידת החקירות המרכזית של מחוז דרום לטיפול ממוקד בבעיה ומאז הקמתו נפתחו 137 תיקים והוגשו 16 כתבי אשום. עשרות תיקים נוספים נמצאים בשלב זה בחקירה.
התרעות פיקוד העורף