נזכיר נתניהו היה העד הראשון בפרשת ההגנה, בו היא מזמנת את עדיה בנסיון להפריך את הטענות של הפרקליטות. הדיונים במשפט ימשכו עד ה-20 ביולי אז תצא מערכת בית המשפט לפגרה והדיונים יעצרו זמנית ויתחדשו רק בתחילת ספטמבר. באוקטובר, לאחר החגים, השופטים קבעו כי הדיונים ייערכו חמש פעמים בשבוע.
כוונתה לדיון ביוני 2023, אז התקיימה שיחה דרמטית בלשכת השופטים בבית המשפט המחוזי בירושלים, אז נאמר: "לצדדים נמסרה, בפתח הדברים, עמדה לפיה קיימים קשיים בביסוס עבירות השוחד שבאישום הראשון בכתב האישום (אישום 4000). על רקע קשיים אלה, הוצע כי המדינה תשקול לחזור בה מעבירות השוחד באישום זה". אולם, נכון לרגע זה הפרקליטות לא שינתה את כתב האישום.