מיד לאחר הכרעת הדין הודיע הרמטכ"ל גדי איזנקוט כי אם יגיש אזריה בקשת חנינה, הוא ישקול בחיוב את קיצור עונשו. אזריה הגיש בקשה, ובספטמבר קבע איזנקוט כי מאסרו יופחת בארבעה חודשים. בניכוי שליש מהתקופה, אזריה צפוי להשתחרר בחודש מאי. איזנקוט ציין בהחלטתו כי אזריה פגע בנורמות ובערכים של צה"ל, אך משיקולי חמלה ובזכות היותו לוחם, הוחלט להפחית מעונשו.
בעקבות ההחלטה ספג הרמטכ"ל הכפשות ואיומים ברשתות החברתיות מצדם של מי שדרשו לשחרר את אזריה מיד. החייל הגיש בקשה לנשיא ריבלין ובה גם סיפר על פגיעה קשה בו ובמשפחתו ועל מצבם הבריאותי של הוריו, שהתדרדר מאז שהחלה הפרשה.