מלכה נחקר היום בחקירה נגדית, ובמסגרתה סיפר על מה שנעשה בעבר בחברת נתיבי ישראל, בעת שאלכס ויז'ניצר ושי הרב שימשו בכירים בחברה. מלכה סיפר על קשר אישי שנוצר בינו לבין עובד בחברה. בחקירתו הנגדית אמר מלכה כי התיאור הדרמטי של מה שקרה בתיק חורג ממה שבאמת היה. "הנפח שזה תפס תקשורתית וציבורית גדול הרבה יותר ממה שבאמת קרה שם. להגיד שזה לא חמור? זה חמור". בתשובה לשאלת סנגורו של רונאל פישר, עו"ד עמית בר, השיב מלכה כי אכן השתמש בכל כישוריו כחוקר כדי להזים כל חשד שהופנה נגדו. עו"ד בר עינת עימת את מלכה בחקירתו הנגדית עם דברים שאמר בחקירה במח"ש, ואף הקרין באולם חלק מחקירתו.
בקטע שהוקרן נראה מלכה אומר לחוקר מח"ש "אני טרוד נורא, קרוע מזה ומנסה להבין מה קורה פה. אני לא ישן לילות, חיכיתי שתקראו לי לדבר סופסוף ולספר את הסיפור האמיתי". מלכה הוסיף ואמר בחקירה: "כמעט בכל תיק צץ לנו שוטר מושחת. אני הראשון לטפל בתיקים האלה, זו תופעה מגעילה".
התרעות פיקוד העורף