את החקירה פתח פרקליטו של שאול אלוביץ', עו"ד ז'ק חן, שהציג תחקיר של העין השביעית מ-2013, שלטענתו מעיד כי הטיית הסיקור באתר וואלה באותה תקופה נבעה ממניעים מסחריים ולא פוליטיים, ללא קשר לנתניהו. בנוסף, במהלך הדיון התייחס עו"ד חן לעמדתו הפוליטית של ישועה ולכך שהתבטא באופן קשה נגד נתניהו מול העובדים, זאת בהתאם לאחד מקווי ההגנה של אלוביץ', לפיו פעל במטרה "למרכז" את האתר השמאלני מתוך עמדה אידיאולוגית.
כמו כן, בניסיון לערער את אמינותו של העד ולטעון כי פעל במניפולטיביות, הקריא חן התכתבויות שונות של ישועה עם שאול אלוביץ', זאב רובינשטיין, ניר חפץ ומעורבים נוספים בפרשה, עליהן אמר ישועה כי "לא התכוון אליהן". ישועה בתגובה השווה את הסיטואציה ל"חצר ביזנטית" והסביר: "כל השיחות האלה היו שיחות ירודות של סריסים בתוך חצר ביזנטית. אמרתי ביטויים בשיח הזה כשידעתי שהצד השני מעביר לה (שרה נתניהו) כל דבר".
התובעת עו"ד יהודית תירוש מתנגדת: "שחברי יציג לעד שהשיח שהעד מדבר עליו עם שאול אלוביץ' לראשונה נאמר לו. חברי יודע שהיטב שהדברים נאמרו כבר בהודעות של העד זה לא דברים שנאמרים פה לראשונה".
ישועה הוסיף: "לא הסתרתי גם בראיון הזה שיש מתח, אני אמרתי ביושר שבכל גוף עיתונאי יש מתח בין התוכן לבין המסחר. מה לעשות שעיתונים, המודל המסחרי שלהם נפגע והם תלויים במפרסמים. ציינתי גם באותה כתבה שאני מתערב ולפעמים מחליט לטובת המסחרי, אבל מספר הפעמים שזה קורה בטל בשישים, וזה לא שהמפרסם יכול לשלוט ברצף של כתבות. יכול להיות שיש כתבה אחת שמעדנים או מורידים אותה, אבל אם זה יגיע שוב זה לא יקרה".
ישועה: "הם נכונים בהסתייגות. אני אמרתי אותם. זה השנים שוואלה הפכה מגוף שמסתמך על עיתון הארץ התחלנו להקים את המערכת שלנו. המעורבות שלי הייתה מינימאלית, בשיקולים מסחריים, או היו דוגמאות מאוד קיצוניות שמדובר ברמה נמוכה. לא ביליתי בדסק החדשות שעות ארוכות. כשהתחלנו להשקיע מיליונים בתחום של התוכן אז עברתי יותר בחלל של הדסק פעם או פעמיים ביום, עשיתי את זה גם בשאר אגפי החברה".
ישועה: "זה לא מקרה שהכתבה הזו יוצאת 8 חודשים לאחר ששאול התחיל בלחץ שלו. בהחלט הייתה התנהלות גוברת של ההנהלה בהפעלת שיטות צנזורה שונות. ייחסו את הכל לאינטרסים מסחריים, עוד לא ידעו על הלחץ הפוליטי. היו התערבויות גם שלי כמנכ"ל מסיבות מסחריות, כן? אבל בתדירות לגמרי שונה".
ישועה הוסיף: "יש כתבות עם אותם עיתונאים שכתבו על הליכוד, זה מבחינתם היה מסחרי. לחברה יש גם שיקולים מסחריים ואמרתי להם את האמת. כולם עושים את זה וגם אנחנו עשינו את זה. במאזן בין שיקולי המערכת לשיקולים המסחריים אני אומר שהמערכת צריכה לנצח ואני גם אומר שאם אני מתערב יכול להיות שלפעמים זו טעות".
ישועה: "אני באמת לא זכרתי שהקלטתי, הרי אני הבאתי את הטלפון מרצוני ושלחתי למשטרה את אותן הקלטות באפליקציה בה השתמשנו. ממה שקראתי בעיתונים הבנתי שהייתה עוד אפליקציה אחרת שלא הייתי מודע לה שהקליטה גם. אתה מציג דרמה כאילו שלחתי הקלטות רק מאפליקציה אחת. מה היה לי להסתיר? למחרת העברתי את הטלפון לחוקרת".
התרעות פיקוד העורף