בהכרעת הדין, נקבע שהנאשם תכנן לבצע פיגוע ירי עם שותפיו, מסר להם כלי נשק ותחמושת, ובהמשך וידא שכוחות אינם נוכחים במקום שבו התכוונו לבצע את הפיגוע. שותפיו של הנאשם זיהו את הרכב של בני משפחת הנקין, ירו לעברו עשרות כדורים בעודו נוסע וגם לאחר עצירתו, ולאחר מכן ירו באיתם ונעמה הנקין ז"ל. בית המשפט הצבאי קיבל את עמדת התביעה הצבאית לפיה יש להרשיע את הנאשם בביצוע העבירות, למרות שלא נכח במקום שבו בוצע הפיגוע.
הנאשם נעצר באוקטובר 2015 ולאחר מעצרו הגישה התביעה הצבאית נגדו כתב אישום וביקשה את מעצרו עד תום ההליכים המשפטיים. בהתאם להחלטת בית המשפט הצבאי, שהה הנאשם במעצר לאורך ההליך המשפטי בעניינו, ומועד לשמיעת הטיעונים לעונש ייקבע בהמשך.
במקביל, התביעה הצבאית נשארת בקשר עם בני משפחתם של איתם ונעמה ז"ל, ומעדכנת אותם בהתקדמות ההליך המשפטי.
שותפיו של הנאשם הורשעו בגרימת מותם בכוונה של בני הזוג הנקין ז"ל ובניסיון לגרימת מותם של ארבעת ילידהם של בני הזוג הנקין. השותפים נדונו לעונש של שני מאסר עולם ו-30 שנות מאסר נוספות לריצוי בפועל.
התרעות פיקוד העורף