במקביל, הפלגים הפלסטינים בעזה הודיעו למתווך המצרי, כי "הפרובוקציות בשטח, והניסיון לשנות את הסטטוס קוו, לא יעברו". בנוסף, הודיעו כי "האמונה בישראל כי ההתנגדות בעזה אינה יכולה לפתוח בסבב חדש הוא שגוי, אנו נמצאים במעקב אחר המתרחש בירושלים, ולנו הזכות להגן על מסגד אל-אקצא. הפלסטינים בירושלים ובגדה המערבית הם קו ההגנה הראשון של המסגד". עוד הוסיפו הפלגים הפלסטינים כי "אם הקיצוניים ינקטו בצעדים המאיימים על הסטטוס קוו בירושלים, כל התרחישים פתוחים, כולל ירי טילים מזירות שונות".
בתוך כך, צה״ל נערך בפריסה רחבה של מערכות כיפת ברזל בזירה הדרומית, למקרה שארגוני טרור פלסטיניים ינסו לבצע ירי רקטות כהזדהות גם מלבנון. בכוחות הביטחון לא לוקחים סיכונים ונערכים כדי להבטיח את שלום וביטחון המשתתפים הערב בצעדת הדגלים ובחגיגות יום ירושלים. זאת בנוסף ל־3,200 שוטרים ולוחמי מג"ב, מתנדבים ויחידות מיוחדות שנפרסו ברחבי העיר כבר מאתמול.