הנשיא יצחק הרצוג הגיב להודעה הקשה, וספד לו: ״משתתף באבל הכבד על נפילתו של לוחם סיירת גבעתי, סמ״ר שילה יוסף אמיר ז״ל בהיתקלות עם מחבל בפיגוע היום אחר הצהרים בקדומים. מחזק את חבריו ולוחמים רבים הנמצאים כל העת על המשמר במשימות קשות ומורכבות. תנחומיי למשפחתו חבריו ואוהביו. יהי זכרו ברוך!״.
מחקירה ראשונית עולה כי המחבל שלף אקדח מחלון רכבו ומטווח קצר ביצע ירי לעבר הכוח הצבאי וסייר הביטחון, לאחר שאלה ניגשו אליו מאחר ועורר את חשדם. לאחר מכן, יצא מהרכב והחל במנוסה רגלית. כוח צבאי שהיה באזור ביצע ירי לעברו, חיסל אותו ובכך ככל הנראה מנע פיגוע קטלני יותר, לאחר שעל פי ההערכה או הסתובב סביב היישוב ונתקל בשערים סגורים. במערכת הביטחון סבורים כי המחבל הגיע לבדו.
"המחבל לא הצליח להיכנס ליישוב. זה נמצא לאורך הכביש, לא בתוך היישוב. בהתחלה היה דיווח על שתי זירות אבל כרגע ממה שאני מכיר, הפרטים עדיין אינם ברורים לפחות בשלב הזה", הוסיף.