התחקיר מצביע על שורה ארוכה של כשלים בהכנת מערך ההגנה של צה״ל. בתפקוד ושליטה של מפקדת אוגדת עזה והחטיבה המרחבית. כבר עתה ברור כי היו כשלים בניהול הקרב, בחוסר חתירה למגע מצד כוחות צה״ל והמשטרה.
קצינים בצה״ל שנחשפו לתחקיר הביעו ביקורת על התחקיר והצגת הדברים. אחד הבכירים אמר: ״התחקיר הזה הוא הנדסת התודעה״. קצין בכיר הוסיף: ״יש בצה״ל קצינים שכשלו ב-7 באוקטובר. הם לא צריכים להיות חלק מהמערכת. ולא ברור למה נותנים להם להמשיך. התפיסה המבצעית שהייתה בצה״ל לא עמדה במבחן הקרב״.