כזכור, המנהלים הקודמים של החברה, כך על פי הודעת הפרקליטות, הואשמו וכעת מחכים לשימוע. הם חשודים בעבירות על חוק ייצוא ביטחוני, כאשר בנוסף מתקיימת חקירה נגד החברה על ידי הרשות לניירות ערך, בסוגיית הונאה ומניפולציה במניות.
במהלך החקירה החל העניין ברכישתה בקרב רפא"ל והתעשייה הצבאית. כתוצאה מהתחרות הבלתי מוסברת בין שתי החברות הממשלתיות, שמתעניינות בחברה פרטית, עלה הערך של החברה, על חשבון הציבור ל-850 מיליון שקלים.
בשלב זה נכנס לתמונה איש העסקים אהרון פרנקל, שהחליט לרכוש המניות של החברה, שהיו בשפל באותה עת בבורסה. בסופו של דבר רפאל קנתה את החברה. איש מערכת הביטחון לשעבר כתב, כאמור, מכתב תלונה למשרד הביטחון, לגורמים נוספים ולמבקר המדינה, וביקש שיבדקו את כל ההתנהלות בנושא החקירה.