המחבל לא עצר, חטף מכונית של אזרח שנמלט מתוכה, נסע במהירות לצומת גיתי אבישר, שם פתח באש לעבר חייל שעמד בצומת ופצע אותו קשה. כמה דקות מאוחר יותר, בשעה עשר בבוקר לערך, מצאו כוחות הביטחון שהוזנקו למקום את הרכב נטוש באזור הכפר בורקין.
החל מרגע הפיגוע החלו כוחות מתוגברים של צה"ל ושב"כ לנהל מרדף אחר המחבל. מחסומים נפרסו בכביש 5 המהווה ציר תנועה מרכזי. הכוחות סגרו את הכניסות לארבעה כפרים פלסטיניים סמוכים ובתקשורת הפלסטינית דווח כי הוטל עוצר על הכפר בורקין.
התרעות פיקוד העורף