סגן מפקד היחידה קצין בדרגת רב סרן, מפקד פלגה ומפקד הצוות שביצע את הירי הודחו מתפקידם. הסמג"ד ומפקד הפלגה יוכלו לחזור ולפקד על החיילים עוד שנתיים. מפקד היחדה סא"ל א' ימשיך אומנם בתפקידו אבל המינוי שלו לתפקיד מח"ט חטיבת מילואים בוטל וקידומו יעוכב בשנתיים.
ממצאי צוות המומחים שהוצגו פחות מחודש לאחר הטרגדיה בנבי מוסא חושפים תמונה קשה וחמורה של ההתנהלות ביחידת אגוז לאחר הגניבה של האמצעי לראיית הלילה, מלוחם שלאחר מטווח לילה התבקש להביא את גבולות הגזרה והשאיר את אפודו יחד עם האמר"ל, בפתח המטווח וכשחזר יחד עם לוחם נוסף גילו כי נגנב.
האלוף במילואים נועם תיבון: "חוסר אחריות לייחס אירוע זה פרשנות של יוזמה וחתירה למגע בהקשר של ריבונות" מדובר באירוע שבו עליו בעיות חמורות מצד מפקדים בסוגיו מקצועיות, שיקול דעת חריגה מפקודת וכן דיווחים חסרים בעיקר במידע שהגיע למפקד היחידה על האירועים שהתפתחו לאחר גניבת הציוד הצבאי".
לצד החלטות אלה, הנוגעות במישרין באירוע הקשה, קבע הרמטכ"ל כי אין להסתפק במסקנות אישיות ויש לנקוט פעולות מערכתיות נרחבות למניעת מקרים מסוג זה. לפיכך, הורה על מספר מהלכים מערכתיים בכלל יחידות צה"ל, אשר מטרתם לעקור מן השורש נורמות פסולות, שהביאו לאירוע הקשה ביחידת אגוז ולהטמיע את הלקחים הנדרשים.
כזכור, בחודש שעבר נהרגו רב-סרן אופק אהרון ז״ל בן ה-28, ורב-סרן איתמר אלחרר ז״ל, בן 26, מפקדי פלגה ביחידת אגוז, כתוצאה מירי של קצין אחר בעקבות טעות בזיהוי, במהלך פעילות אבטחה סמוך למחנה צה"ל בבקעת הירדן.
השניים, ששירתו ביחידת הקומנדו, נהרגו הלילה, כאמור, כתוצאה מטעות בזיהוי שהובילה לירי דו-צדדי סמוך לבסיס בבקעת הירדן. האירוע הקשה התרחש במהלך פעילות אבטחה בסמוך למחנה צה"ל בבקעה. מצה"ל נמסר עוד כי ההודעה נמסרה למשפחותיהם, וכי נסיבות המקרה נבדקות.
במהלך האירוע ביצעו שני הקצינים פטרול, כאשר בשלב מסוים הבחינו בדמות חשודה ופתחו בנוהל מעצר חשוד לעברה. אותה דמות, קצין מאותה יחידה שחשש כי מדובר באירוע פח"ע, פתח לעברם באש והרג אותם.
התרעות פיקוד העורף