העימותים בהר הבית התחדשו גם הבוקר (שישי), כאשר הסהר האדום הודיע כי לפחות 57 בני אדם נפצעו עד כה. עם סיום תפילת הצהריים המרכזית, בה לקחו חלק על פי דיווחים שונים כ-150 אלף איש, דיווחו כלי תקשורת פלסטינים כי התחדשו העימותים בין כוחות הביטחון לבין מתפרעים במקום.
על פי חלק מהדיווחים, נעשה שימוש במל"ט על למנת לפזר גז מדמיע במתחם המסגד. בנוסף נטען כי הסהר האדום טיפל ב-26 מקרים של חנק כתוצאה מהגז מדמיע.
#شاهد | لحظة إلقاء مسيرة تابعة للاحتلال قنابل الغاز بشكل عشوائي على المصلين في ساحات #الأقصى قبل قليل pic.twitter.com/vF3x8iiRcC
— المركز الفلسطيني للإعلام (@PalinfoAr) April 22, 2022
מאות בני אדם פתחו בהפרת סדר ויידוי אבנים במהלך תפילת הפג'אר בשעות הבוקר. חלקם רעולי פנים שהניפו דגלים של ארגון חמאס, שאף ביצעו ירי זיקוקין לכיוון גב הכותל ופגעו בעץ שהחל לבעור בשטח הר הבית. צוותי כיבוי פעלו לכיבוי השריפה בתוך דקות.
לאחר פיזור מפרי הסדר הגיעו למקום מתפללים רבים ולפני זמן קצר, הסתיימה בהר הבית תפילת הצהריים של יום השישי השלישי בחודש הרמדאן ופיזור המתפללים. במהלך התהלוכה הושמעו קריאות הסתה ולאחר שניסו לתקוף ולפגוע בנקודת משטרה נעולה. התהלוכה פוזרה תוך שימוש באמצעים לפיזור הפרות סדר וכרגע שקט במקום.
בתוך כך, משטרת ישראל עצרה חשוד (המשויך לארגון "חיזב אל תחריר") לאחר שהלילה נשא דברים מול המון מתפללים בהר הבית, במהלכם הסית וקרא להגן על אל אקצה ״ולשחרר את המסגד באמצעות נשק וכוח״. בהמשך דבריו הובילו לקריאות המוניות בשבח מוחמד דף. החשוד תושב, בית חנינא בשנות השישים לחייו, נעצר לחקירה בחשד לקריאה לאלימות, טרור ולהפרת הסדר הציבורי.
בתוך כך, מפכ"ל המשטרה רנ"צ קובי שבתאי והשר לביטחון פנים עמר בר לב קיימו הבוקר הערכת מצב מיוחדת בירושלים. במסגרת הערכת המצב הוצגה תמונת המודיעין, היערכות המשטרה ומג"ב, פעילות מחוז ירושלים והצעדים שינקטו לאור האירועים האחרונים.
למרות ידויי האבנים, המשטרה המתינה לסיום התפילה ופיזור המתפללים. לאחר שהמתפרעים המשיכו ביידוי אבנים מסיבי, כולל לכיוון גב הכותל המערבי, בו שהו מתפללים יהודים, כוחות המשטרה השתמשו באמצעים לפיזור הפרות סדר והדיפת ההמון לאחור.
דברי השר לביטחון הפנים עמר בר-לב בתום ביקורו היום בחפ"ק המשטרה בכותל: "גם הבוקר פועלים השוטרים באופן נחוש ואחראי מול מתפרעים מוסתים ואלימים, שהם אלו שפוגעים בחופש הפולחן של מוסלמים בהר הבית ושל יהודים בכותל. נמשיך לפעול ביד קשה מול הפורעים הללו כדי לאפשר את המשך התפילות. אני מאחל החלמה לשוטרת שנפצעה בעימותים".
במהלך הפרות הסדר האלימות וידויי האבנים, נפצע רעול פנים שהפר את הסדר ויידה האבנים עם אחרים לעבר גב הכותל המערבי, והוא פונה לקבלת טיפול רפואי ע״י כוחות המשטרה וגורמי החירום וההצלה.