במקביל למצעד, החלו להתפרסם דיווחים מהם עלה כי ארגוני הטרור ברצועת עזה מתכוונים לשבש את הצעדה ולהגיב, ככל הנראה, בירי רקטות לעבר ישראל. בכיר בג'יהאד האסלאמי איים: "ההתנגדות נערכת לתגובה שתשפיע משמעותית על הסכסוך עם האויב, כדי ללמד את האויב לקח שלא יישכח".
ראש הלשכה המדינית של חמאס, איסמעיל הנייה: "כל האפשרויות על השולחן, אנחנו מתכוננים לכל תרחיש. אנחנו נמצאים בכיבוש שעבר זמנו, כוחות הכיבוש רוצים לבטל את הישגי שומר החומות אבל אנחנו אומרים בצורה ברורה - מחוגי השעון לא ישובו לאחור". הוא התייחס למסגד אל-אקצא שבהר הבית ואמר כי "זה הנכס שלנו, יש מולנו אפשרויות ברורות להיאבק בניסיונות לחלל אותו".
שיא חדש בהר הבית נרשם היום לרגל יום ירושלים, עם עלייתם של 2,626 להר הבית לראשונה מאז שחרורו בשנת 1967. השיא הקודם בהר הבית נרשם גם הוא ביום ירושלים, לפני ארבע שנים. אז עלו להר הבית 2,084 יהודים. עליית היהודים להר הבית הסתיימה ללא אירועים חריגים, למעט ירי זיקוקים שבוצע מדי פעם מתוך המסגד, וכן התבצרות קצרה במסגד עצמו, שפוזרה על ידי כוחות הביטחון. מנגד, הסהר האדום טען כי טיפל ב-15 פצועים, ארבעה פצועים פונו לקבלת טיפול בבתי החולים.
למרות ההתרגשות הרבה, במהלך ההכנות למצעד הדגלים הותקפה חברת הכנסת מירי רגב כאשר אבן הושלכה לעברה, פגעה במאבטח הצמוד לה ופצעה אותו. מקורביה של רגב סיפרו כי היא השתתפה באחת מצעדות הדגלים, ולאחר סיום הצעדה ושירת "התקווה", הושלכה אבן לעברה אך פגעה במאבטח. האחרון נפצע בראשו באורח קל וקיבל טיפול רפואי.
כאמור, במשטרה התירו עלייה של יהודים להר הבית בשעות הבוקר, ביניהם ח"כ איתמר בן גביר. כוחות הביטחון נערכו בכוננות גבוהה מאוד, גם לאפשרות שההסלמה תגיע כבר ביציאה מהתפילה – הרבה לפני שיתחיל מצעד הדגלים.
"אני מצפה שהמשטרה תפעל ביד קשה. נדהמתי לראות עשרות שרצו לכיוון שלי בצעקות וקללות, התפקיד של המשטרה הוא לעצור אותם ולזרוק אותם מהר הבית", אמר חבר הכנסת בהצהרה לתקשורת.