בעקבות הביקורת על דרך הצגת התחקירים הוחלט בצה״ל לשנות את סדר הצגתם, זאת לאחר שבקרב קצינים במטה הכללי נשמעים קולות אשר טוענים כי קודם היה נדרש לתחקר ולהציג את התמונה הכוללת של אירועי השבעה באוקטובר.
לטענתם, היה צריך קודם לשים את הפוקוס על דרגי הפיקוד הבכיר ורק אחר כך על הקרבות במקומות השונים. בתוך הצבא ומחוצה לו תוהים רבים על הדרך והעיתוי שבהם הוצגו תחקיר הקרב בבארי.
כמו כן, תוהים רבים על אופי הביקורת שעלתה בתחקיר על ההחלטות הטקטיות שקיבלו מפקד ולוחמי צוות הכוננות הראשון של יחידת שלדג ויחידת הקומנדו של חיל האוויר שהגיע ראשונה לקיבוץ ב-7 באוקטובר ונלחמה לבדה (צוות של 13 לוחמים במשך שעות אל מול מאות מחבלי חמאס).
התרעות פיקוד העורף