ברקע ההחלטה של שר הביטחון, בהסתדרות הכינו מהלך נגדי ובארגון מסרו לפני זמן קצר כי "ארגון עובדי צה"ל בהסתדרות הכריז היום על סכסוך עבודה בתחנת גלי צה"ל, זאת בעקבות ההחלטה החד צדדית של שר הביטחון ישראל כ"ץ, לסגור את התחנה עד ליום 1.3.26. הסכסוך יחול על כמאה אזרחים עובדי צה"ל המועסקים בתחנה".
עוד אמרו בהסתדרות כי "החלטה חד צדדית ומיידית לסגירת תחנת גלי צה"ל עד ליום 1.3.2026, וזאת מבלי שנוהל מו"מ בנוגע להשלכות סגירת התחנה, ולמרות שלהחלטה השלכות משמעותיות על זכויות ותנאי העבודה של העובדים, לרבות ביטחונם התעסוקתי עקב סיומי העסקה צפויים".
עוד נמסר: "דרישת נציגות העובדים שלא ייושמו המלצות הוועדה לבחינת פעילות גלי צה"ל שהגישה מסקנותיה, זאת לאור הוראת היועצת המשפטית לממשלה, שלפיה הוועדה שהוקמה לא תגיש את המלצותיה עד להשלמת בחינה משפטית בשל טענות לפגמים שנפלו בהליכי המינוי של הועדה וחבריה. התנהלות חסרת תום לב ודורסנית, בפרט בהתחשב בעובדה שכבר הושגו הסכמות בין ארגון עובדי צה"ל לבין משרד הבטחון בנוגע לשינוי מבני בתחנה, לאחר ועדת זמיר שכבר בדקה את פעילות התחנה והחלה ליישם את מסקנותיה.