על פי ההסדר, בכל יממה יעבירו המצרים רשימה של 50 עזתים המבקשים להיכנס לעזה ממצרים. לאחר בדיקה ביטחונית של השמות תתאפשר הכניסה ביום שלמחרת. במקביל, אנשי הארגון האירופי יעבירו למצרים רשימה של 150 עזתים המבקשים לצאת מהרצועה, כולל היעד הסופי שאליו הם מתכוונים להגיע, והמצרים יוכלו לאשר או לסרב לבקשות היציאה.
בסמוך למעבר הציבה ישראל שרוול בדיקה הכולל מערך בידוק מרחוק של הנכנסים, במטרה לוודא באופן חד-משמעי כי הנכנס הוא האדם שאושרה כניסתו וכי אינו מבריח אמצעי חבלה או כלי נשק.
החשש המרכזי בירושלים הוא ניצול המעבר על ידי גורמי טרור, גם בדרגים נמוכים, לצורך יציאה מהרצועה או חזרה אליה תחת כיסוי הומניטרי. בשל כך הובהר כי כל חריגה, ניסיון זיוף או חוסר שקיפות מצד הגורמים המעורבים עלולים להביא להקפאה מיידית של המהלך.
מנגד, בקהיר מבקשים להבטיח שהפתיחה לא תהפוך, ולו בעקיפין, למנגנון של יציאה חד-כיוונית מהרצועה. מכאן נובעת המחלוקת סביב שאלת המכסות והאיזון בין מספר היוצאים למספר הנכנסים - מחלוקת שטרם הוכרעה סופית, וצפויה להיבחן מדי יום בהתאם להתנהלות בשטח.
התרעות פיקוד העורף