מתחקיר של אוגדת איו"ש עולה כי לקראת החג צה"ל תיגבר את הכוחות שלו במספר חוות חקלאיות ברחבי איו"ש. אחת מהן היא החווה "זית לגלבוע" בצפון השומרון לא הרחק מהעיר ג'נין. לפי החלטת הממשלה, על שטח החווה אמור לקום בקרוב הישוב מעיינות.
מהתחקיר עולה כי בשעות הבוקר יצא אחד מאנשי החווה לרעות את העדר. הוא זכה לאבטחה של לוחם שהיה בחווה במסגרת התגבור של צה"ל לקראת החג. הלוחם, חניך בקורס מכ"ים לא שירת בעבר בגזרת איו"ש והפעילות בבוקר שבת היתה הפעילות המבצעית הראשונה שביצע בגזרה.
בשלב מסוים חרגו רועה הצאן והלוחם מהשטח בו הם מורשים לרעות את הצאן. קבוצה של כמה עשרות מתושבי הכפר פקועה הסמוך יצאו לכיוון השניים והחל אירוע חיכוך. בשלב הזה הזעיק הלוחם את אנשי החווה וכן את כוח האבטחה הצבאי שהיה בה. על פי גירסת החיילים והמתיישבים הם חשו סכנה כאשר הם ראו כיצד הפלסטינים מכתרים אותם וחלקם מתקדם לעברם. הלוחם ביצע ירי באוויר במטרה להרחיק את הפלסטינים. בשלב מסוים הוא נראה בסרטונים כשהוא מבצע ירי לעבר רגלו של אחד הפלסטינים, אשר נפצע מהירי.
בעקבות התחקיר הוחלט באוגדת איו"ש להעביר את האירוע לחקירת מצ"ח. הלוחם נעצר והוא נחקר בחשד לביצוע ירי לא מידתי. גורם צבאי אומר כי "נוהלי הפתיחה באש באיו"ש מאוד מאפשרים שימוש בירי במקרה של סכנה לכוחות. אולם בכל מקרה ירי, צריך לראות שהוא בוצע על פי הנהלים והייתה הצדקה לבצעו במטרה לפגוע. צה"ל פועל על פי חוק והשימוש בנשק חייב להיות מושכל ומידתי - אנחנו לא מיליציה שבה כל לוחם יורה ללא מדרג מול סכנה".