במקביל, בעקבות ניסיון פיגוע דריסה במרחב מוצב גנים שבחטיבת מנשה, כוחות גדוד 890 שהיו בנקודה הגיבו בירי לעבר הרכב וחיסלו את המחבל. מחבל נוסף אשר שהה ברכב נעצר על ידי הכוחות. כוחות צה"ל ומג"ב פועלים כעת בנקודה.
לפי הדיווח הראשוני, בוצע ירי מרכב לעבר מתרחצים במעיין סמוך לנווה צוף. גבר כבן 30 שישב ברכבו נפצע כתוצאה מהירי באורח אנוש, וצוותי מד"א שהוזעקו למקום העניקו לו טיפול רפואי. לאחר פעולות החייאה, מצבו השתפר מאנוש לקשה והוא פונה לבית החולים בלינסון באמצעות מסוק. במקום נפגע חרדה נוסף.
כוחות צה"ל מחטמ"ר בנימין, מיחידת דובדבן, פלוגות תגבור נוספות ומשטרת ישראל פתחו במרדף אחרי המחבל. ההערכה היא כי המחבל יצא מרכבו כשהוא חמוש ונמלט רגלית. הוצבו חסמים בכל הגזרה והכוחות סורקים אחר המחבל רגלית ובעזרת רחפנים, ואף הוקפצו כלים של חיל האוויר.