הפצ"ר קבע בהחלטתו כי חומרת המעשים נובעת גם מהעובדה שבוצעו על-ידי קצין ומפקד בכיר מאוד ומנוסה, אשר אמור לשמש בהתנהגותו דוגמה אישית ליישום קפדני של פקודות הצבא. במהלך החקירה, נטל תת-אלוף כהנא אחריות וביקש לסיים את תפקידו ולפרוש מצה''ל. לאור זאת, ולאור העובדה שבמרבית הציוד לא נעשה שימוש פרטי, הורה הפרקליט הצבאי הראשי על טיפול פיקודי והעמדתו של הקצין לדין משמעתי.
"מזה 28 שנים אני משרת בצבא בשדרות הלחימה והפיקוד", כתב תא"ל כהנא במכתב הפרישה לרמטכ"ל, "הובלתי אלפי חיילים בלחימה ולקחתי חלק משמעותי בכל מערכות ישראל מאז שהתגייסתי, כחייל וכמפקד, ועד לתפקידי הנוכחי. במשך כל השנים צה"ל היה לי, למעשה, לבית ראשון, נתתי את כל מאודי לצבא ותמיד שמתי לנגד עיניי את טובתו ואת טובת החיילים והמפקדים".
התרעות פיקוד העורף