כ-900 אלף תושבים מתגוררים ב-407 יישובי עימות הנמצאים סמוך לגבולות ישראל ובאיו"ש. בדיקת משרד מבקר המדינה העלתה כי במשך שנים רבות יישובי העימות אינם מקבלים את מלוא מרכיבי הביטחון שהם זכאים להם. בנוסף מצאה הביקורת שהיקף המשאבים המושקע בשיקום ואחזקת מרכיבי הביטחון השונים קטן מהנדרש בצורך המבצעי שהוגדר על ידי מערכת הביטחון עצמה, הבעיה הזו בולטת במיוחד ביישובים ביהודה ושומרון.
בביקורת עלו גם ליקויים בכל הקשור בניהול ובבקרה של פיקוד העורף את מרכיבי הביטחון ביישובים - בניהול ומעקב אחרי מרכבים הקשורים למרכיבי הביטחון ביישובים ובניהול רשימת פערים נמצאו ליקויים נתון שמקשה על הבקרה שאמורה לשקף את מצב הכשירות של היישובים. חוסר בתחנות ממסר פוגע ביכולת להשתמש במערכת הקשר המשותפת "ברק כתום" וכתוצאה מכך נפגעת התקשורת בין צה"ל לכוחות ההגנה ביישובים, המבקר קובע כי נוכח החשיבות הרבה של נושא זה יש לפתור מצב זה בהקדם האפשרי.
בכל הנוגע לתיאום בין הגופים הרלוונטיים בצה"ל להגנת יישובי העימות, בימים אלו מבוצעות עבודות מטה המגדירות את ממשקי העבודה וסדר העדיפויות בנושא, בהתאם להערכת המצב. ככלל, צה"ל מבצע התאמה של מרכיבי הביטחון לכל יישוב בהתאם לסיווגו ולאיומים הקיימים. תכנית העבודה בנושא טיפול במרכיבי הביטחון לשנת 2018 נכתבה בשיתוף היחידה להתיישבות, זאת על מנת לוודא את התיאום בין הגופים.
בכל הנוגע למעורבות הרבש"צים בביטחון יישובי העימות, בעקבות ההערות שעלו במהלך הביקורת, חודדו ההנחיות לכל כוח המגיע לתעסוקה מבצעית בנוגע למחויבותו לקיום קשר מול הרבש"ץ. צה"ל אחראי לזמן את הרבש"צים להערכות מצב תקופתיות ולעדכנם בכל נושא רלוונטי ובהתאם לאירועים. צה"ל רואה את תפקיד הרבש"ץ כגורם משמעותי לביטחון הגזרה ועל כן, מקיים בקרה בנושא. בכל עת נמצאים פיקוד העורף והפיקודים המרחביים בקשר שוטף ומקצועי עם ראשי הרשויות המקומיות ובעלי התפקידים הביטחוניים על פי צורך ודרישה".