את השנתיים האחרונים ניצלו בחמאס להתעצמות גם בזירה הימית, בחסות ההסדרה, ובמיוחד לאור ההבנה שהמכשול התת קרקעי שנבנה בשנים האחרונות, מקשה על חדירות לשטח ישראל באמצעות המנהרות, חמאס קידם בשנתיים האחרונות בצורה משמעותית את היכולת הימית שלו על מנת שבשעת מלחמה מול ישראל יוכל לפגוע בכי השייט של חיל הים, באסדת הגז ולחדור בצלילה דרך הים, על מנת לבצע פיגועי ראווה בשטח ישראל, כפי שכמעט הצליח במהלך מבצע צוק איתן, כאשר כוח של 4 מחבלים הצליחו לחדור לשטח ישראל, אך לאחר קרב נהרגו על ידי לוחמי צה"ל.
בצה"ל סבורים כי המוטיבציה, לבצע פיגועים דרך הים, נוכח הקשיים במנהרות והיבלו לכך שחמאס הלך והשקיע יותר ויותר משאבים בפיתוח ובניה של אמל"ח מתקדם בתוך הרצועה.
ההישג המערכתי שעומד בפני חיל הים במבצע זה, הוא לפגוע ולשלול את היכולת הימיות של חמאס והגא"פ ולעצור באופן מוחלט את הניסיונות לביצוע פיגועי איכות, לבצע פעולות קומנדו, שמעבר לפגיעה באזרחים ולוחמים מטרתם גם תודעתית בהגעה להישג. עד לשלב הזה, חמאס וארגוני הטרור לא הצליחו להוציא אל הפועל פיגוע מהים.
במבצע הזה, ניסיונות החדירה סוכלו עוד בשלב המקודם, באמצעות תקיפות רבות למטרות שנותחו לפני המבצע, הקשורות ליכולות של חמאס שגם קו החוף מופגז באופן שיטתי על ידי לוחמי חיל הים, וכן בהפעלה של כלי טייס של חיל האוויר.
בצה"ל סבורים כי מפקד הקומנדו הימי של חמאס נעלם לחלוטין ואינו מתפקד ובכירם נוספים חוסלו, כך שהכוח הימי מתקשה לתפקד. צוות החוד המיוחד של הקומנדו הימי, שעליו מפקד גם מפקד הקומנדו הימי שנעלם, אינו מתפקד, כך על פי צה"ל. למרות מה שמתואר בחיל הים כהישג גדול, מדגישים בצבא כי צריך לקחת בחשבון כי למרות שכל המטרות הידועות נפגעו, יתכנו עוד פיגועים מהים וייתכן שישנם גם איומים, אותם המודיעין של צה"ל אינו מכיר.
בצה"ל הדגישו כי כי בכל מקרה גם בעת הלחימה ניתן להפעיל אותה, אך כל עוד אין מצוקת אנרגיה בישראל, והגז הנדרש מגיע מאסדות אחרות, מוטב לנקוט אמצעי זהירות. עוד סבורים כי בנוסף לאמצעי הלחימה, הספינות וכלי השיט של חמאס הצליחו לפגוע בכל המנהרות, שמחברות לאורך החוף בין היבשה ישירות למנהרות בים, בצורה כזו שאמורה היתה לאפשר לצוללנים של חמאס להגיע לעומק הים מבלי שיזהו אותם על היבשה.
איום נוסף שבצה"ל מוטרדים ממנו, הוא מעין צוללות מתאבדות זעירות ואוטונומיות, המכוונות באמצעות GPS ונבנו בייצור עצמי ברצועת עזה. עם זאת, בצה"ל העריכו כי פגעו ברוב הצוללות הזעירות, אך יתכן כי בידי חמאס נותרה היכולת שבאמצעותה חמאס מבקשים לבצע פיגועים כנגד כלי השיט של צה"ל.
ההערכה בצה"ל כי זמן השיקום של חמאס את היכולות המבצעיות שלו בים, ייקח לפחות שנתיים, כאשר גם מבחינת התשתיות לאורך החוף, צה"ל השמיד 17 מוצבים.
התרעות פיקוד העורף