בצה"ל מעריכים כי מדובר בהתפרצות וגניבה כשהגנבים מסתייעים במידע ושיתוף פעולה לכאורה של גורמי פנים, היינו חיילים המשרתים באותו בסיס. מפקד פיקוד הצפון, אלוף אורי גורדין, הנחה על הקמת ועדת מומחים שתחקור את נסיבות הפירצה בבסיס צה"ל ברמת הגולן. בראשות הוועדה יעמוד ממפקד חטיבה 4, אלוף-משנה מיקי שרביט. הוועדה תתחקר ותבדוק את כלל הגורמים והכשלים שאפשרו את אירוע גניבת התחמושת ממחנה צנובר, וממצאי התחקיר יוצגו למפקד הפיקוד בתוך כחודש.
מחקירה ראשונית שהחלה בעקבות בדיקה שנערכה עלה כי בספירת מלאי שבוצעה בליל שבת נמצא כי 70 אלף כדורים מסוג 5.56 נעלמו ולא נמצאו בבונקרים המקום שבו היו אמורים להימצא כמו גם 70 רימוני מטול נפיץ. בצה"ל הטילו איפול על החקירה וממצאיה, אולם מדובר צה"ל נמסר: "תחמושת צבאית נגנבה מבסיס צה"ל בצפון הארץ. נסיבות הגניבה נחקרות בידי המשטרה הצבאית החוקרת, ועם סיום החקירה יועברו הממצאים לבחינת הפרקליטות הצבאית".
התרעות פיקוד העורף