עם הגעת לוחמי הימ"מ והשב"כ למבנה שבו שהה המבוקש, הוא נמלט מתוכו, והסתתר בעודו חמוש במבנה אחר שבו שהו מספר בלתי מעורבים. לוחמי הימ"מ פרצו למבנה ועצרו את המבוקש. במהלך מעצרו, נתפסו גם נשק ומחסניות שהיו ברשותו.
במהלך פעילות הכוחות, יודו לעברם בקבוקי תבערה, אבנים ומטענים. בתגובה הם ירו לעבר המחבלים, זוהו פגיעות. המבוקש הועבר לחקירה בשירות הביטחון הכללי.