במכתב שפרסם כתב צלאל: "מעולם לא השתייכתי לצד זה או אחר ואיני בוחר צד גם היום. מערכת החינוך היא ממלכתית ויש לשמור עליה כזו. יש לקחת אותה כעת, לחשב מסלול מחדש וגם באמצעותה לפעול לאיחוי הקרעים. אני פונה לכל אנשי החינוך היקרים - אני גאה בכם ומעריץ את עשייתכם. המשיכו בתפקידכם המקצועי וממשו את אחריותכם הגדולה. כנציג ציבור אני מבקש לקחת אחריות ולסיים את תפקידי. הקרע אליו הגענו אינו מאפשר לי להמשיך ולממש את אחריותי כהלכה, וכפועל יוצא הודעתי הבוקר, י' באב תשפ"ג, לשר החינוך על החלטתי לסיים את תפקידי במשרד".
"אני מודה לשר יואב קיש על ההזדמנות, החברות והשותפות האמיתית והכנה, אני מאמין מאוד בתוכנית העבודה אותה ישמנו יחד לשנים הקרובות ומשוכנע שהשר ידע להוביל את המערכת החיונית, אותה הוא כל כך אוהב ופועל למענה, למקומות טובים עוד יותר במעלה הדרך. כטייס אמשיך לטוס ולשרת בצה"ל בראש מורם, כי זו משמעות המשפט -'אין לי ארץ אחרת גם אם אדמתי בוערת'", הוסיף צלאל.
השר קיש מסר בתגובה: "אסף שימש כמנכ״ל משרד החינוך בחצי שנה האחרונה, ובינינו הכרות ארוכת שנים המושתתת על שותפות וחברות. אני מודה לאסף על ביצוע תפקידו באופן מקצועי ומסור, תוך שימת דגש על טובתם של תלמידי ישראל והערכות לפתיחת שנת הלימודים. אני מאחל לו הצלחה רבה בכל אשר יפנה. בחרתי במנהל מחוז ירושלים מר מאיר שמעוני, שהינו איש חינוך מוערך ומקצועי ובעל ניסיון של עשרות שנים במשרד החינוך, לתפקיד מ״מ מנכ״ל. שמעוני ייכנס לתפקיד באופן מיידי, תוך כדי חפיפה מסודרת עם המנכ״ל היוצא".
״מנהיגים״, ארגון מנהלי בתי הספר, בתגובה להתפטרות מנכ״ל משרד החינוך: ״התפטרות מנכ״ל משרד החינוך אסף צלאל היא קריאת השכמה עם דגל אדום שמתנוסס מעליה. מערכת החינוך חייבת להישאר ממלכתית, נאמנה למדינה, לחברה הישראלית כולה ולא לסקטור פוליטי כזה או אחר".
ממועצת התלמידים והנוער הארצית נמסר: "בימים בהם המדינה בוערת והשסע החברתי הולך וגדל, זו העת לגלות מנהיגות חינוכית ולקדם פעולות למען קירוב לבבות ואיחוי הקרעים בחברה הישראלית. אנו במסגרת מועצות התלמידים והנוער, נמשיך להילחם על אחדות החברה הישראלית. יחד עם זאת, אנו מאחלים למר אסף צלאל הצלחה בדרכו החדשה ורוצים להודות לו על העמדת התלמידים וצרכיהם בראש סדר העדיפויות, על התייחסות למועצת התלמידים והנוער הארצית כשותפים למהלכים חינוכיים, שהתבטאו בקשר רציף עם יושב ראש המועצה היוצא, רן שי ובקבוצות מיקוד שקיים מעת לעת".
התרעות פיקוד העורף