ב-27 ליוני 2007 נמצא מרואן ללא רוח חיים על הרצפה מתחת למרפסת דירתו בעיר לונדון. לא ידוע האם נפל, קפץ או נדחף מן המרפסת. גם במקרה זה, ישנן גרסאות סותרות באשר לאחראים למותו - כאשר בעוד רעייתו של מרואן האשימה את "המוסד" הישראלי, מקורות במשטרת לונדון טענו כי ייתכן ונרצח בידי סוכנים מצרים כנקמה על כך שריגל למען ישראל. לאחר מותו, טען מובראק כי השמועות שריגל למען ישראל הן שקר.
מובראק בראיון: אשרף מרואן היה סוכן כפול והיתל בישראל
העיתונאית הכווייתית פג'ר א-סעיד חשפה כי נשיא מצרים המודח טען בפניה שחתנו של נאצר לא היה מרגל של המוסד, אלא העביר ידיעות שגויות למודיעין הישראלי
התרעות פיקוד העורף