ביקור נוסף בקהיר תוכנן על ידי לשכת נתניהו בחורף 2016, כשנתיים לאחר עלייתו של הנשיא הנוכחי א־סיסי לשלטון. הביקור בוטל על ידי המצרים על רקע דברי שר האנרגיה יובל שטייניץ, שלפיהם מצרים הציפה מנהרות של חמאס לבקשת ישראל.
בספטמבר 2017 נועדו נתניהו וא־סיסי לפגישה קצרה בניו יורק. מאחורי המנהיגים הוצב דגל מצרים בלבד. א־סיסי אמר בפתח הפגישה: "תודה רבה לך שהגעת לפגישה עם האורחים הנכבדים". דוברו של נשיא מצרים עדכן כי הפגישה עסקה בדרכים לחידוש תהליך השלום בלבד.
במאי 2018 דווח כי נתניהו וא־סיסי נפגשו במצרים בחשאי. לפי מקורות שונים, נתניהו טס למצרים עם מספר קטן של יועצים ומאבטחים, שהה שם כמה שעות והשתתף בארוחת שבירת צום הרמדאן. הפעם, לפי מקורות מדיניים, נתניהו מתכוון להגיע לקהיר באופן גלוי, ולעסוק בעיקר בנושאים כלכליים.
התרעות פיקוד העורף