נתניהו טען כי אי האמון שלו בראש השב"כ החל ב-7 באוקטובר והתגבר עם הזמן - "הרבה לפני ההחלטה על פתיחת החקירה בעניין קטר". לדבריו, "הפיטורים לא נועדו למנוע את החקירה, החקירה נועדה למנוע את הפיטורים".
מנגד, בסביבת ראש הממשלה דוחים על הסף את הטענות ומציינים כי "ראש הממשלה ביקש מראש השב"כ להציג לו את התחקירים כבר בפגישה ביניהם שנערכה ב-29 בינואר 2024".
גורמי לשכת רה"מ מוסיפים כי "כוונת ראש הממשלה לסיים את תפקידו של ראש השב"כ פורסמה בתקשורת כבר בתחילת נובמבר 2024 - שלושה חודשים לפני פתיחת החקירה בענייני קטר". לראייה, הם מפנים לדיווח באתר "ערוץ 7" מה-18 בנובמבר 2024 שכותרתו: "דיווח: נתניהו שוקל לפטר את ראש השב"כ רונן בר".