לאחר החלטת הממשלה על ביטול ההחלטה הקודמת שלה, הממשלה פונה לבג"ץ בבקשה למחוק את העתירות שהוגשו נגד פיטורי בר ולבטל צווים שניתנו. עורך הדין ציון אמיר, פנה בשם הממשלה לבג"ץ, בדרישה כי לאחר החלטתו של רונן בר להתפטר ולאחר ביטול החלטת הממשלה לפטר אותו, בג"ץ יקרא לבטל את העתירות. "העתירות אינן הפכו תיאורטיות, כשהסעד שהתבקש ע"י העותרים, ביטול ההחלטה האמורה, הוא אינו נדרש עוד", כתב עו"ד אמיר.
בדברי ההסבר להחלטה נכתב כי "ראש הממשלה סבר מלכתחילה כי מן הראוי שרונן בר יפרוש בצורה מוסכמת ומכובדת מתפקידו כראש השירות כפי שפרש הרמטכ"ל. התפטרותו של רונן בר מגיעה במועד מאוחר מדי, חמישה שבועות לאחר שהממשלה החליטה על הפסקת כהונתו וגם מועד סיום כהונתו שצוין במכתב ההתפטרות מאוחר מאוד. עם זאת, תהליך מינויו של ראש השירות הבא יארך זמן ותקופה זו תנוצל להעברה מסודרת של התפקיד".
התרעות פיקוד העורף