השר אליהו לא חסך בביקורת חריפה כלפי הפצ"רית, ואמר: "מדובר בפצ"רית שהעלילה עלילות דם על חיילי צה"ל, שותפה לתפיסת עולם מסוכנת שפוגעת בצבא, ומשמיצה את מדינת ישראל. אנחנו רוצים מערכת משפטית וייעוץ משפטי – אבל לא כזה שפוגע בנו. הייעוץ המשפטי כיום מזיק למדינה. הפצ"רית פוגעת בצבא ופוגעת ביכולת שלנו לנצח את המלחמה".
לדבריו, הבעיה עמוקה יותר ונוגעת לחינוך ולתפיסת הסמכות במערכת הביטחונית: "שנים חינכו אותנו במערכות הצבאיות שהדרג המקצועי קובע – ולא הדרג המדיני. זה דבר שצריך להשתנות. אנחנו נתקן את החינוך שהשתרש פה במדינה. בדמוקרטיה – מי שקובע זה הדרג הנבחר".
בהתייחס לרמטכ"ל עצמו, אמר אליהו: "אם הוא מתעמת עם שר הביטחון, כנראה שהוא לא מבין מהי דמוקרטיה. אני מבין מאיפה זה בא – במשך שנים תקשורת המיינסטרים כמו רשת ב' מטפטפת ארס, כאילו דמוקרטיה פירושה שלטון הפקידים. אבל זו לא דמוקרטיה, וזה לא שלטון העם". כאשר נשאל האם יש להדיח את הרמטכ"ל, השיב אליהו: "אני לא חושב שזה שחור ולבן. הדברים משתנים. אנחנו מתקנים, לא כל דבר שהוא לא מסכים עליו צריך להשליך אותו מכל המדרגות. ויכוחים כאלה טובים – הם מדייקים את העבודה של הממשלה והצבא".
התרעות פיקוד העורף