הסמכויות שיהיו בידי נתניהו מחולקות לשתי קטגוריות. הראשונה היא קביעת המנדט של ועדת החקירה, דבר שנקבע בחוק של קלנר באופן מפורש - "הממשלה תגדיר את נושאי החקירה". המשמעות היא כי הוועדה לא תוכל לחקור מה שהממשלה לא תאשר לה.
הקטגוריה השנייה היא קביעת הרכב חברי הוועדה. כביכול תחת מעטה של אחדות, החוק משרטט תנאים לשליטה בלעדית של נתניהו בהרכב חברי הוועדה, באמצעות חברי הליכוד הנמצאים בתפקידי מפתח בקואליציה.
לפי החוק שנתניהו מקדם, יש שלוש אפשרויות להקים את ועדת החקירה: הראשונה קובעת כי הוועדה תוקם ב"הסכמות" בין חברי הכנסת, כאשר הדבר מחייב הצבעה של 80 חברי כנסת בעד ההצעה במליאת הכנסת. דרך זו היא פיקציה, כיוון שאין 80 חברי כנסת שיתמכו בהקמת ועדת חקירה בדרך זו.