המינוי עורר ביקורת חריפה בקרב גורמים במערכת הבריאות, בשל עמדותיה הפומביות של סון הר-מלך בשנים האחרונות. חברת הכנסת התבטאה בעבר נגד מדיניות משרד הבריאות בתקופת הקורונה והביעה הסתייגות מחיסונים ומהתנהלות הגופים המקצועיים. אנשי רפואה ובריאות הציבור הביעו חשש כי עמדות אלה עלולות להשפיע על אופי עבודת הוועדה ועל היחסים בינה לבין הדרג המקצועי.
מנגד, בסביבתה של סון הר-מלך דוחים את הביקורת וטוענים כי מדובר בהתנגדות פוליטית ולא עניינית. סון הר-מלך עצמה מסרה לאחר אישור המינוי כי היא רואה בתפקיד “שליחות ציבורית”, והבהירה כי בכוונתה לנהל את הוועדה “בגישה מקצועית ועניינית”, לחזק את מערכת הבריאות הציבורית ולפעול לכך שכל אזרח בישראל יקבל טיפול רפואי איכותי, ללא קשר למקום מגוריו או לרקע החברתי שממנו הוא מגיע.
בקואליציה מדגישים כי המינוי נעשה בהתאם לכללים הפרלמנטריים וכי אין כל מניעה שחברת כנסת מעוצמה יהודית תעמוד בראש ועדה מרכזית. עם זאת, גם גורמים בקואליציה מודים בשיחות סגורות כי מדובר בתפקיד רגיש, המחייב איזון עדין בין עמדות פוליטיות לבין עבודה מקצועית מול משרד הבריאות, קופות החולים ובתי החולים.
ועדת הבריאות אמונה על פיקוח פרלמנטרי על מערכת הבריאות כולה, עוסקת בין היתר בסל התרופות, בזכויות מטופלים, בהיערכות לחירום רפואי ובמדיניות בריאות הציבור. על רקע האתגרים המצטברים במערכת, הציפייה כעת היא שהוועדה תחזור לפעילות סדירה ואינטנסיבית.
התנועה הלהט"בית "מרימה", ביקרה גם היא את המינויים: "הממשלה הכי גרועה ללהט"ב ממנה שני שונאי אדם, שונאי שוויון, שונאי חופש לתפקידים שיש להם השפעה ישירה על חיים של צעירים ובני נוער להט"בים. האלימות, הדם, השנאה והפחד של נער שיחטוף מכות בבית ספר כי יו"ר ועדת החינוך פגע בתקציבים או של אנשים שימותו כי קוצצו להם תקציבי בריאות מצילי חיים במשמרת של סון הר מלך - על הידיים של נתניהו. הוא שונא להטב, הוא מסוכן ללהט"ב ואם הוא ימשיך לשלוט לא יהיה סיכוי לחיות פה כלהט"ב".
ד"ר רתם סיון, יו"ר פורום ישראל בריאה: "זהו רגע קשה שעוד עלול לעלות בחיי אדם. בימים של התפרצות מגפת השפעת והחצבת, ועדת הבריאות, שאמורה להגן על חיי אדם, בחרה לאשר מינוי מסוכן, מבלי לקבל תשובות ברורות. במהלך הדיון התחמקה ח"כ סון הר-מלך מלהשיב לשאלה פשוטה וקריטית: האם היא מתנגדת לחיסונים בישראל. כשמדובר בבריאות הציבור, התחמקות כזו היא נורת אזהרה אדומה ומסוכנת לחיי אדם".