ב-25 בספטמבר 1997, חצי שנה אחרי הרצח בנהריים, ניסתה ישראל להתנקש בראש הלשכה המדינית של חמאס לשעבר, חאלד משעל עמאן. על פי הדיווחים, סוכני מוסד, מצוידים בדרכונים קנדיים ריססו רעל לאוזנו של משעל. למורות זאת הוא לא מת ושניים מהסוכנים נעצרו ע"י שירותי הביטחון בירדן. היתר הצליח לברוח לישראל.
התקרית גרמה למשבר דיפלומטי עם הממלכה ההאשמית, רק שלוש שנים לאחר חתימת הסכם השלום. ראש הממשלה בנימין נתניהו שוחח עם המלך חוסיין, שדרש, בתמורה לשחרור הישראלים, תמסור ישראל לירדן את הנוגדן לרעל ותשחרר אסירים, ביניהם המנהיג הרוחני של חמאס, שיח' אחמד יאסין.
ב-19 בינואר 2010, מחמוד אל מבחוח, אחד ממייסדי גדודי עז א-דין אל קסאם, הזרוע הצבאית של חמאס, נהרג בחד המלון שלו בדובאי. המשטרה המקומית פרסמה צילומים של 26 חשודים. על פי הדיווחים, לפחות שישה מהם זוהו כאזרחים בריטים וחמישה אחרים עם דרכונים אירופים אחרים.
ב-31 במאי 2010, כוחות שייטת 13 פשטו על המרמרה, אנייה הטורקית, שכשעליה מאות נוסעים, רבים מהם טורקיים, עשתה דרכה לרצועת עזה בניסיון לשבור את המצור שהטילה ישראל על האזור. במהלך ההשתלטות על הספינה, החלו הנוסעים לתקוף את החיילים. במהלך העימותים נהרגו תשעה מהנוסעים, שמונה מהם אזרחים טורקיים. פצוע נוסף מת מפצעיו שלוש שנים לאחר מכן.
התרעות פיקוד העורף