לשכתו של יו"ר הרשות הפלסטינית אבו מאזן (מחמוד עבאס) פרסמה הודעה המגנה את ההסכם, ובה נכתב כי "לאף אחד אין זכות לדבר בשמם של הפלסטינים".
מחמאס נמסר כי "נורמליזציה לא עולה בקנה מידה אחד עם ההיסטוריה של סודאן שתמכה בסוגיה הפלסטינית", וכי מדובר ב"צעד בכיוון הלא נכון".
בכיר אש"ף ואסל אבו-יוסף אמר בתגובה להסכם, כי זוהי "דקירה נוספת בגב שלנו". גם בג'יהאד האסלאמי גינו את ההסכם, ומסרו כי "ההסכם הנו בגידה בפלסטין ובאומה, ואיום על זהותה ועתידה של סודאן".
עוד נמסר, כי "המשטר הסודאני גולש לתוך החיבוק הישראלי ומעניק בחינם מתנה לישראל מתוך כספי העניים והעקורים".