בעקבות העימותים, תקף ח"כ טאהא: "כמה מכוער ועלוב פרצופו של הכיבוש הארור! הכיבוש גם רצח את שירין אבו עאקלה, זכרה לברכה, בדם קר, וגם מונע מהמוני המשתתפים לכאוב את מותה! התנהלות גורמי הביטחון לפני ובמהלך הלוויה מעוררת מיליון סימני שאלה לגבי אלה שקיבלו את ההחלטות! בושה וחרפה".
השר עיסאווי פריג' טען כי "משטרת ירושלים ביזתה היום את זכרה ואת הלווייתה של שירין אבו עאקלה. האלימות המשטרתית והלהט להחרים כל דגל פלסטיני, בניגוד להנחיית השר לביטחון פנים, הם שהביאו להתלקחות מיותרת. המשטרה גילתה אפס כבוד לאבלים ואפס הבנה של תפקידה כמי שאמונה על שמירת הסדר, לא על הפרתו".
כאמור, בטרם יציאת מסע הלוויה ובתחילתו, החלו הנוכחים וקריאות הסתה והפרות סדר אלימות ברחבת בית החולים שכללו יידוי אבנים וחפצים לעבר השוטרים. בעקבות כך, החלו השוטרים בפיזור והדיפת הפורעים ובביצוע מעצרים, זאת על מנת לאפשר את קיום הלוויה. לדברי המשטרה, מבין מיידי האבנים והחפצים השונים היו גם כאלה שהיו בקרבת ארון הקבורה. המתפרעים ו אף גרמו נזק לרכב הלוויה וניסו למנוע ממנו להסיע את ארון הקבורה.
עוד נמסר: "אנו מצרים על הניצול הציני שעושים גורמים מסיתים, במותה של העיתונאית. הלוויה נמשכת בשעה זו". עד כה נעצרו שישה חשודים שהפרו את הסדר הציבורי ותקפו שוטרים לפני ובתחילת מסע הלוויה שנמשך בשעה זו.
התרעות פיקוד העורף