בנוסף לכך שסבל מאובדן שמיעה, למלחין הקלאסי המפורסם היו תלונות חוזרות ונשנות על בעיות במערכת העיכול לאורך חייו, כמו גם מחלת הכבד. בטהובן כתב מכתב לאחיו ב-1802, לפיו ביקש שהרופא שלו, יוהאן אדם שמידט, יקבע את אופי "מחלתו" לאחר מותו ויחשוף אותה ברבים.
יצירותיו של לודוויג ואן בטהובן כללו את סונטת אור ירח משנת 1801, והייתה לו השפעה עצומה על עמיתיו המלחינים כשביניהם יוהנס ברהמס ופרנץ ליסט. לפי מכתבים שכתב, ניכר כי המלחין צרך אלכוהול באופן קבוע. למרות שקשה לדעת כמה הוא שתה, חבר קרוב כתב שבטהובן שתה לפחות ליטר יין לצד ארוחת הצהריים בכל יום.