מעורבותו האישית של כהן בפעולה נגד בית הדין התרחשה בזמן שכיהן כראש המוסד. פעילותו אושרה ברמה גבוהה ונומקה בכך שבית הדין מהווה איום בהעמדה לדין של אנשי צבא, לפי בכיר ישראלי.
מקור ישראלי אחר, שתודרך על הפעולה נגד בנסודה, אמר כי מטרת המוסד הייתה לפגוע בתובעת או לגייס אותה כמי שתשתף פעולה עם דרישות ישראל. מקור שלישי המעורה בפעולה אמר כי כהן פעל כ"שליח הבלתי רשמי של נתניהו".
ארבעה מקורות אישרו כי בנסודה תדרכה קבוצה קטנה של בכירים בבית הדין בנוגע לניסיונותיו של כהן להשפיע עליה, על רקע חששות מאופי מאיים והתמדתי של התנהגותו. לפי גרסאות שהועברו לבכירי בית הדין, כהן לכאורה אמר לה: "את צריכה לעזור לנו ולתת לנו לטפל בך. את לא רוצה להסתבך בדברים שיכולים לסכן את הביטחון שלך או של המשפחה שלך".
המוסד גם גילה עניין רב בבני משפחתה של בנסודה והשיג תמלילים של הקלטות חשאיות של בעלה, על פי שני מקורות בעלי ידע ישיר על המצב. בכירים ישראלים ניסו להשתמש בחומרים כדי להכפיש את התובעת.
הגילויים על פעילות כהן מהווים חלק מתחקיר עתידי של "הגרדיאן", "+972 מגזין" ו"קול מקומי", החושף כיצד סוכנויות מודיעין ישראליות ניהלו "מלחמה" חשאית נגד בית הדין במשך כמעט עשור.