ההערכה ההולכת וגוברת כי מדובר בפעולה של איראן על אדמת אבו דאבי, כאשר החקירה מנוהלת על ידי גורמי הביטחון של איחוד האמירויות והמוסד. האיראנים מתנהלים בחופשיות באבו דאבי מאחר ומדובר במדינות החולקות גבול ימי. החוקרים בחנו מספר תרחישים: חטיפה כשהחטוף והחוטפים נמצאים על אדמת אבו דאבי, אפשרות לרצח והסתרת הגופה בקרבת מקום, או חטיפה לאיראן. עד כה ידוע כי לפחות חלק מהחולייה המעורבת בפעילות עזבה לטורקיה.
המטה לביטחון לאומי (מל"ל) חידד את המלצתו להימנע מנסיעות שאינן חיוניות למדינה. על איחוד האמירויות חלה אזהרת מסע ברמה 3 (איום בינוני) אשר המלצתה להימנע מנסיעות שאינן חיוניות ליעד וקורא לשוהים בנסיכויות לנקוט באמצעי הזהירות הבאים:
ראש הממשלה בנימין נתניהו התייחס לרצח בפתח ישיבת הממשלה. "הרצח הזה בוצע באיחוד האמירויות. רצח של אזרח ישראלי ושליח חב"ד, זהו פיגוע טרור אנטישמי נפשע. אני שולח גם בשמכם תנחומים מעומק הלב למשפחת קוגן. מדינת ישראל תפעל בכל האמצעים, ותמצה את הדין עם הרוצחים ושולחיהם. איש מהם לא יינקה.
"אני מאוד מעריך את שיתוף הפעולה עם איחוד האמירויות בחקירת הרצח. אנחנו נחזק את הקשרים בינינו דווקא למול הניסיונות של ציר הרשע לפגוע ביחסי השלום בינינו. נחזק אותם, ונפעל גם להרחיב את היציבות באזור".