בתחום הביטחון הלאומי, חקירה בת עשור עם ה-FBI בנושא מאמציה של איראן לעקוף סנקציות בין לאומיות ולמכור נפט בשוק השחור למימון הטרור, נפגעה קשות. תיקים שמטרתם תפיסת מכליות נפט וחשבונות בנק נזנחו למשך חודשים, כי הסוכנים היו עסוקים מדי במשימות הגירה כדי לראיין מקורות או לנסח תצהירים לתפיסה. בינתיים, ספינות וכספים נעלמו לפני שניתן היה לתפוס אותם. גורם אחד ציין כי "כסף ונפט חמקו מידינו".
בנוסף, משרד המודיעין של המחלקה, שאמור להפיץ דוחות מודיעין על טרור ואיומים אחרים, הונחה להתמקד יותר בתמיכה באכיפת הגירה. בעקבות זאת, רשויות אכיפת חוק מקומיות מקבלות כעת פחות דוחות מודיעין באופן משמעותי, מה שגורם לדברי גורם אחד ל"כרסום בכל מה שנבנה מאז 11 בספטמבר".
לצד זה, סוכני ביטחון המולדת החוקרים פשעים מיניים נגד ילדים הועברו מתפקידם למבצעי האכיפה נגד מהגרים למשך שבועות, מה שהפריע למרדף שלהם אחר עברייני מין. חקירת ביטחון לאומי בנושא השוק השחור לנפט איראני, הנמכר למימון טרור, הואטה במשך חודשים בשל ההסטה למשימות הגירה, מה שאפשר למכליות נפט וכספים להיעלם.
המהפך הארגוני הוא סטייה בולטת עבור הסוכנות הענקית שהקונגרס יצר בתגובה למתקפות הטרור של 11 בספטמבר 2001. על המחלקה לביטחון המולדת הוטל למנוע טרור, להגן על הנשיא, לחקור פשיעה בין לאומית ולהגיב לאסונות טבע, בין יתר תפקידיה. אכיפת חוקי ההגירה הייתה אחת ממשימות רבות, אך לא נועדה להיות תפקידה הבלעדי. כיום, ממשל טראמפ הפך את הסוכנות למעשה ל"מחלקה לגירוש".