הוא נכנס למדינה תחת השם הלמוט גרגור, כשהוא נושא דרכון איטלקי. ממשלת ארגנטינה דאז, הייתה נודעה בכך שהיא מספקת מחכה לנאצים, מה שהוביל לקהילה מחתרתית של ממש לשגשג במדינה. קהילה שכל כולה הם נאצים שנמלטו מעונש מוצדק למעשיהם.
אחד הדברים שנמצאו בתיק, הוא ריאיון מצמרר עם שורד שואה, שסיפר על הזוועות שביצע מנגלה: "הוא אסף תאומים מכל הגילאים במחנה וערך עליהם ניסויים שתמיד הסתיימו במוות. איזה זוועות".
בשנת 1956 ביקש מנגלה את תעודת הלידה המקורית שלו משגרירות מערב גרמניה בבואנוס איירס, ולמרבה הפלא החל להשתמש בשמו האמיתי, וביקש שידפיסו מחדש את תעודות הזהות.
המסמכים מצביעים על כך שסוכנויות ארגנטינאיות ידעו שמנגלה התגורר בקראפאצ'י, עיירה בפאתי בואנוס איירס, ושהוא נישא לאלמנת אחיו באותה תקופה. בנוסף, אביו אף ביקר אותו בארגנטינה.
בשנת 1959 הוציאה מערב גרמניה צו מעצר נגד מנגלה, וביקשה את הסגרתו, אך שופט מקומי דחה את הצו בטענה שהוא מבוסס על "רדיפה פוליטית".
ההסגרה הכושלת הובילה ללחץ בינלאומי על ארגנטינה, ומנגלה נמלט לפרגוואי שם קיבל אזרחות, על פי הרישומים. כאשר הרשויות הארגנטינאיות פשטו לבסוף על המעבדה הרפואית שלו בבואנוס איירס, הנאצי כבר לא היה שם.
התרעות פיקוד העורף