הדיונים התקיימו בישיבות חשאיות של מועצת המומחים – גוף של 88 אנשי דת האחראי לפי החוקה על בחירת המנהיג העליון – שנערכו באופן מקוון בשל שיקולי ביטחון בזמן המלחמה. ההצבעה הראשונית, שנערכה ב-3 במרץ, העניקה למוג’תבא חמינאי רוב של שני שלישים, אך ההכרזה על עלייתו נעצרה ברגע האחרון בעקבות התנגדות מצד בכירים בממסד.
למרות המחלוקות הפנימיות שקדמו למינויו, הממסד האיראני הציג כלפי חוץ חזית מאוחדת, בעוד מוג’תבא חמינאי טרם הופיע בפומבי. המינוי מסמן גם את עוצמתו של המחנה הקשוח בממסד, וגם את המורכבות הרבה של הירושה הפוליטית והדתית בצמרת הרפובליקה האסלאמית בזמן של משבר צבאי ופוליטי.