בערך באותו הזמן קיבלו השוטרים דיווחים על ירי במרחק כמה רחובות משם. ירי בוצע לעבר גנן נוף - שלא נפגע. השוטרים מצאו רכב באמצע הרחוב ובו שני אנשים מתים, שלכאורה היו היורים, כשבגופם פצעי ירי - כנראה ירי עצמי.
כל שלושת הקורבנות היו גברים בוגרים. אחד מהם היה מאבטח במרכז האסלאמי, שלדברי ואהל כנראה "מילא תפקיד מרכזי במניעת הסלמת האירוע". על פי דיווחים, החשודים בירי הם בני 17 ו-19. בשל מקום הירי, הוא נחקר כעת כפשע שנאה.
המרכז האסלאמי של סן דייגו הוא המסגד הגדול ביותר במחוז, על פי אתר האינטרנט של המרכז. הוא מארח את חמש התפילות היומיות, תפילת יום שישי ודרשה, וכן שיחות וסמינרים חינוכיים.
משרד ה-FBI בסן דייגו מסר כי הוא מסייע בחקירה, ומשרד האלכוהול, הטבק, כלי הנשק וחומרי הנפץ (BATFE) בלוס אנג'לס מסר כי הוא מעורב גם בחקירת האירוע.
התרעות פיקוד העורף