המהלך מגיע לאחר חקירה של הסוכנות האמריקנית לפיתוח בינלאומי, USAID, שהמליצה, לפי הדיווח, להשעות או לפטר יותר מ־100 עובדים של אונר"א. ממצאי החקירה הצביעו לכאורה על עובדים שהיו מעורבים בפעילות אזרחית וצבאית של חמאס, ובהם אנשי חינוך, מנהלי בתי ספר ובעלי תפקידים נוספים.
משרד החוץ הישראלי תקף בחריפות את הודעת אונר"א וטען כי הסוכנות מנסה להציג את הפיטורים כמהלך טכני בלבד. בהודעה שפורסמה מטעם המשרד נטען כי העובדה שאונר"א לא הזכירה את חמאס בהודעתה, ואף הפנתה אצבע מאשימה כלפי ישראל, היא "טיוח ציני". בישראל טוענים כי האחריות לניקוי שורות הסוכנות מטרור מוטלת על האו"ם עצמו, ולא על ישראל.
באונר"א מנגד דוחים את הטענות לשיתוף פעולה פעיל עם חמאס, וטוענים כי פעילותה ברצועת עזה מתבצעת בתנאים קשים ובסביבה ביטחונית מורכבת. בסוכנות מדגישים כי אין לה יכולות מודיעין או שיטור עצמאיות, וכי כמו גופים אחרים של האו"ם היא נאלצת להסתמך על שיתוף פעולה מצד מדינות וגורמים בשטח כדי לשמור על פעילותה ועל ניטרליותה.
התרעות פיקוד העורף