מוקד ההרס המרכזי והדרמטי ביותר הוא קניון "איאון" סמוך לעיר קוממוטו, שקרס חלקית בעקבות פיצוץ עז שאירע כשעה בלבד לאחר רעידת האדמה. שמונה בני אדם חולצו מההריסות, ביניהם שתי נשים בשנות ה-20 לחייהן שמותן נקבע במקום. רשת השידור הציבורית של יפן, NHK, דיווחה כי בין 20 ל-30 מעובדי הקניון עדיין מוגדרים נעדרים.
ההשלכות ההרסניות לא נעצרות שם. שבעה בני אדם נעדרים וארבעה נוספים נפצעו באורח קשה בעקבות קריסת ארובה במפעל נייר מקומי. במקביל, בתי החולים באזור קורסים תחת העומס הפתאומי; בית חולים אחד בעיר אוקי הפסיק לתפקד לחלוטין עקב הפסקת חשמל והפך ל"בית חולים שדה", בעוד מוסד רפואי אחר נאלץ להשעות קבלת חולים חדשים לאחר שקלט 86 פצועים. בנוסף, מספר נוסעים שהיו על רכבות מהירות בזמן הרעידה נפצעו, וכל שירותי הרכבות הושעו באופן מיידי.