בכירים טורקיים וסעודים סיפקו הסברים סותרים להיעלמותו, כאשר אנקרה טענה כי אין ראיות לכך שהוא עזב את הנציגות הדיפלומטית, בעוד שריאד טענה כי הוא יצא ממנה באותו יום. מקור טורקי אמר עוד כי קבוצה של 15 אזרחים סעודים הגיעה לאיסטנבול ונכנסה לקונסוליה באותו יום שבו חאשוגי ביקר שם, ומאוחר יותר עזבה את המדינה.