מבקריו אמרו כי כי במהלך חמשת שנות שלטונו, דוטרטה עודד את המשטרה לבצע אלפי חיסולים של חשודים במסגרת מה שהוא כינה "המלחמה בסמים".
במהלך כהונתו, סיפק דוטרטה לא מעט אמירות בעייתיות וחריגות. ב-2018 אמר במהלך נאום כי "ככל שיהיו יותר נשים יפות כך יהיה יותר אונס". בנוסף לכך, אמר במהלך ביקור ביפן: "הייתי הומו אבל החלמתי בזכות נשים יפות". דוטרטה אף השווה את עצמו להיטלר בהתייחס למאבקו נגד הפשע במדינתו.
התרעות פיקוד העורף