עם זאת, גם ההנחיות העדכניות מייחסות חשיבות לשליש של ההריון בו האישה נמצאת, כאשר מומלץ לנשים הנמצאות בשליש השני או השלישי של ההריון - כן להתחסן. בנוגע לשליש הראשון נכתב כי התקופה מאופיינת "בשיעור גבוה יחסית של דימומים והפלות ספונטניות. כמו כן, זו התקופה שבה מרבית המומים העובריים נוצרים. חשוב לציין כי בכל היריון קיים סיכון בסיסי של 3-5% למומים מולדים בעובר ו- 10-15% להפלות מוקדמות.נשים שאינן שייכות לקבוצות הסיכון, הנמצאות במהלך השליש הראשון להריון – על מנת למנוע חשד לקשר, אף מקרי, בין קבלת החיסון ותופעות אלו, ניתן להתחסן החל מהשליש השני".
עוד נכתב כי "קיימת אפשרות שבדומה לזיהומים נגיפיים אחרים, נגיף הקורונה עלול לגרום נזק שלייתי גם בתחילת ההריון, לו ייתכנו השלכות על העובר, מהלך ההריון והיילוד. האמצעי להפחתת הסיכונים מהמחלה היא על ידי התחסנות מוקדמת".
במקביל הם ציינו כי רצוי להימנע מביצוע החיסון סביב מועד ביצוע דיקור מי שפיר, כאשר מומלץ לשמור על מרווח של לפחות שבוע ימים בין החיסון לדיקור, זאת כדי להימנע מחום או תופעות לוואי אחרות, העשויות להתפרש כסיבוך של הדיקור. בנוסף, הבהירו כי "בשל חומרת מחלת הקורונה ופגיעתה הקשה, אנו חוזרים וממליצים לכלל האוכלוסייה, ובמיוחד לנשים בגיל הפוריות, לנשים הרות ולנשים מיניקות להמשיך ולהקפיד על שמירת כללי הריחוק החברתי ועל עטיית מסכה ובכך להקטין את סיכון החשיפה והדבקות במחלה.