הסיבה לכניסתו של כוכבי לבידוד היא דיון שנערך ב-22.3.2020, במהלכו נכחו מפקדים של יחידת הקישור לרשויות של פיקוד העורף. אחד מהמפקדים אובחן היום כחולה בנגיף הקורונה. לצד כוכבי, בדיון האמור השתתפו גם מפקד פיקוד העורף וראש אגף המבצעים, ועל כן ייכנסו גם הם לבידוד עד סוף השבוע.
על פי הדיווחים, בלשכת ראש הממשלה הדגישו כי נתניהו אינו לוחץ ידיים בפתח פגישותיו, וכי ישב בקצה השני של השולחן בפגישה במרחק של לפחות מטר וחצי ממנו. כמו כן, על פי הפרסומים, חליוה עצמו לא פיתח סימפטומים המזוהים עם הנגיף, כך שלפי הנחיות משרד הבריאות נתניהו אינו נזקק להיכנס לבידוד ביתי.