מנגד, לאחרונה עלו גם דיונים בנושא העברת סמכויות הטיפול בקורונה לידי משרד הביטחון, בראשות בני גנץ, שאמר בראיון בכאן ב' כי "צריך להשתמש בצה"ל ופיקוד העורף כדי לתת שירות טוב יותר".
גם יו"ר ישראל ביתנו, אביגדור ליברמן, סבור כי יש להעביר את הטיפול באירוע לפיקוד העורף. בפוסט שפרסם בחשבון הפייסבוק שלו כתב: "הטיפול והמידע בהתפשטות המחלה חייבים לעבור לפיקוד העורף. זה הגוף היחיד שצריך לתאם, לרכז ולתכלל את המאבק הלאומי במגפה. אני קורא לבני גנץ לקחת את המושכות לידיים, להוכיח מנהיגות ולעמוד על כך שכל הסמכויות בטיפול בקורונה יעברו לפיקוד העורף ויפה שעה אחת קודם".
התרעות פיקוד העורף